Jeżeli tę samą osobę skazano na kilka kar skutkujących pozbawieniem wolności, wykonuje się je w takiej kolejności, w jakiej wpłynęły do wykonania orzeczenia, którymi wymierzono te kary. Zastępcze kary pozbawienia wolności oraz zastępcze kary aresztu za nieuiszczoną grzywnę wykonuje się w ostatniej kolejności.

Sędzia penitencjarny może zarządzić wykonanie kar w innej kolejności, jeżeli względy penitencjarne za tym przemawiają. Należy zatem złożyć stosowny wniosek do właściwego Sądu Okręgowego Wydziału Penitencjarnego z nową propozycją wykonywania kar i odpowiednio go umotywować. W tym celu warto zwrócić się do obrońcy (adwokata), które pomoże odpowiednio sporządzić i uzasadnić wniosek. Sąd penitencjarny rozpoznaje wniosek o zmianę kolejności odbywania kar pozbawienia wolności na posiedzeniu w Zakładzie Karnym.

Co ważne zmianie wykonywania kar podlegają kary już odbyte przez skazanego, a także kara aktualnie przez niego wykonywana, o ile kary te wykonywane są w ramach jednego pobytu w zakładzie karnym. Zmiana wykonywania kar może okazać się niezwykle korzystna dla skazanego.